- Laboratório de Bioquímica e Biologia Molecular
- Laboratório de Entomologia Médica
- Laboratório de Imunoepidemiologia
- Laboratório de Malacologia
- Laboratório de Parasitoses por flagelados
- Laboratório de Simulídeos
- Laboratório de Vetores
- Núcleo de Avaliação e Pesquisa
- Núcleo de Estudos em Malária
- Seção Técnica de Pesquisa em Vetores